A presença de clubes nacionais no EA FC 25 continua limitada, com alguns deles aparecendo apenas na Copa Libertadores e com elencos genéricos. A situação contrasta com versões anteriores do jogo, quando a Série A do Brasileirão estava completamente licenciada. No entanto, existe um aceno positivo com a chegada do EA FC 26, que pode marcar a volta dos times brasileiros ao game.
Marcelo Paz, presidente da Liga Forte União (LFU), sugeriu em entrevista recente que os times brasileiros podem retornar com o lançamento do EA FC 26 este ano. A ausência das equipes na franquia ocorre devido à necessidade de negociações individuais — já que, ao contrário da Europa, o Brasil não tem uma liga única que centralize os direitos de imagem dos jogadores e dos clubes.